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（1）肠梗阻：在便秘和部分性肠梗阻的基础上，逐渐或突然发展为完全性肠梗阻，如未及时进行积极治疗，往往导致死亡。
（2）小肠结肠炎：这是新生儿HD最严重和常见的并发症。
小肠结肠炎的病理：结肠为主要受累者，黏膜水肿，往往发生溃疡和局限性坏死，炎症向肌层浸润。在严重病例整个结肠充血、水肿、增厚、呈暗紫色，浆膜上有灰黄色纤维素覆盖，腹腔内可有少量液体，病儿发生渗出性腹膜炎。小肠在一定范围内亦有炎症。
小肠结肠炎发作时，病儿全身情况突然恶化，高热、呕吐、多次腹泻，并迅速出现严重脱水征象，腹部异常膨胀，小肠尤其结肠极度充气扩张，引起呼吸窘迫和面色青紫。腹壁皮肤发红，似有感染状，做直肠指检或插肛管时有大量奇臭的粪液或气体溢出。小肠结肠炎的病死率很高。