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发现多数瘘管被覆有厚层鳞状上皮，Patey（1958）观察到瘘管均系炎性肉芽组织构成，并与乳晕下主导管相通。多数学者认为本病与恶性肿瘤无关。但也有作者报道一些现象如：绝大多数瘘管管壁由慢性炎性肉芽组织构成（包括结核性肉芽肿），仅个别病例被覆有分化良好的复层鳞状上皮，这与Patey等的观察基本相同。同时观察到病灶及周围组织、导管上皮、腺上皮、肌上皮细胞增生，随着病程的延长发现增生的细胞的体积与胞浆比例增大，细胞数量与层次增多，核染色变深，细胞核由小圆形变为大圆形，杆状，核仁显著。
其中导管上皮及肌上皮细胞反应明显，并有形成导管内乳头状瘤及管内癌的倾向。Rueden在研究乳腺导管内癌复习病理资料时，也认为癌是腺小叶及导管上皮增生转化而来。因此有作者认为：如果瘘管得不到及时治疗，在长期炎症的刺激下有恶变的可能。