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脂肪酸在供氧充足的条件下，可氧化分解生成CO2和水，并释放出大量能量供机体利用，在体内脂肪酸氧化以肝和肌肉最为活跃，而在神经组织中极为低下。脂肪酸在体内的氧化分解是从羧基端的β碳原子开始，每氧化一次断裂脱去两个碳原子，烃链的β碳原子被氧化成为羧基，即“β氧化学说”。
脂肪酸β氧化过程可概括为活化、转移、β氧化及最后经三羧酸循环被彻底氧化生成CO2和H2O并释放出能量等四个阶段。
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