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哺乳类动物体内脂肪酸氧化除β氧化之外，尚有α与ω-氧化等次要方式。下面介绍脂肪酸ω-氧化：中长链的脂肪酸(8C～12C)在过氧化物酶体或内质网内可进行另一种少见的氧化方式，在加单氧酶(混合功能氧化酶)作用下，使远离羧基的末端甲基羟化，生成ω-羟脂肪酸，后再经胞液中的醇、醛脱氢酶催化而氧化为α、ω-二羧酸，其可在任一端被活化后进行β-氧化，最终产生二羧酸;最多见的为琥珀酸，它可经三羧酸循环被彻底氧化或转入其他代谢途径;如若产生的二羧酸不能再进行代谢，将随尿排出。
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