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偏头痛病程较长，但预后良好。据对确诊的73例偏头痛儿童30年观察随访，在发病开始6年内缓解率为62%，在30岁时缓解率降为40%（部分人再发），但大多数发作程度轻，频度较儿童期少，30%病人自始至终头痛。近年有报道小儿偏头痛发作过程中有时并发脑梗死，被称为偏头痛中风，其机制不明，可能与血小板聚集后的微血栓形成有关。
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