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细菌的结构包括基本结构和特殊结构。细胞壁、细胞膜、细胞质和核质为都具有的基本结构，荚膜、鞭毛、菌毛和芽胞为某些细菌才具有的特殊结构。特殊结构——1膜2毛1芽胞
(一)细胞壁 细胞壁为包绕在细胞膜外的膜状结构，厚l0～80纳米(nanometer，nm)，其组成较复杂，因不同细菌而异，主要组分为肽聚糖，主要功能为保持菌体固有形态和维持菌体内外的渗透压。
(二)细胞膜 细胞膜为包裹细胞质的结构，厚约7.5nm，与真核细胞膜相比，不含胆固醇，具有①渗透和运输作用;②呼吸作用;③生物合成作用;④参与细菌分裂细菌的细胞膜向细胞浆内陷，并折叠形成囊状物，叫中介体，为细菌细胞膜内陷而成。扩大了膜表面积，相应地增加了呼吸酶的含量，可为细菌提供大量能量。功能类似真核细胞的线粒体，故有拟线粒体之称。
(三)细胞质 细胞质位于菌体内部的原生质，内含核蛋白体、质粒等多种重要结构。
(四)核质 核质由细胞质内的细菌本身遗传物质DNA和RNA聚集而成，不具备完整的核结构，故亦称为拟核。
二、肽聚糖的结构
肽聚糖或称粘肽，由N一乙酰葡萄糖胺与N一乙酰胞壁酸借β-1,4糖苷键连接为聚糖骨架，再与四肽侧链及五肽交联桥共同构成。肽聚糖为细菌所特有，在革兰阳性(G+)菌与G一菌有所不同。
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