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肥胖发生的内因是指肥胖发生的遗传生物学基础。遗传因素表现在两个方面：一是遗传因素起决定性作用。现已证明人体的第15号染色体有缺陷，可导致一种罕见的畸形肥胖;二是遗传物质与环境因素相互作用而导致的肥胖。目前研究较多的是后一种情况，并已发现有近20种基因突变与肥胖的发生有关。环境因素在肥胖发生、发展上也起非常重要的作用，而且大多数情况是遗传因素与环境因素共同作用的结果。有学者做过统计，肥胖大约有40%～70%由遗传因素决定，环境因素占30%～60%;还有学者认为遗传因素只占30%，而环境因素却占到了60%以上。因此在理解肥胖发生的原因上，不可忽视环境因素的作用。