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健康管理师一共有《理论知识》及《操作技能》两个考试科目。理论知识考试主要考查从业人员从事本职业应掌握的基础知识，考查内容包括临床医学、预防医学、流行病学以及营养与食品安全等。技能操作主要考查从业人员从事本职业应该具备的技能水平，包括健康监测、健康风险评估和分析、健康指导等。
大部分地方的健康管理师考试采用机考形式，即《理论知识》和《操作技能》两个科目都为人机对话形式，考生需操作电脑作答。但由于当下健康管理师考试都是由各个省市自主组织进行的，因此考试形式并不统一，具体情况考生还需咨询当地考试中心。
当下国家仅开放了健康管理师三级的考试，健康管理师三级考试用书有两本，分别是《健康管理师基础知识》及《健康管理师国家职业资格三级》，两本教材全都由人民卫生出版社出版。
当下健康管理师考试由各地自行组织，因此考试题型也不一样，比较常见的考试题型有：单选题、判断题、多项选择题、综合分析题、简答题等。考生如果想详细了解所在地健康管理师考试题型，还需要关注当地考试中心通知。
目前健康管理师已经取消全国统一考试，改成各个省自行组织考试，所以各个地方考试时间不一致。目前已经公布考试时间的地区是：重庆、四川、吉林、湖北、陕西、广西等地。考生如想了解所在地的健康管理师考试安排，可关注当地考试中心通知。