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健康管理师一共有《理论知识》及《操作技能》两个考试科目。理论知识考试主要考核从业人员从事本职业应掌握的基础知识，考查内容涵盖临床医学、预防医学、流行病学及营养与食品安全等。技能操作主要考核从业人员从事本职业应具备的技能水平，有健康监测、健康风险评估和分析、健康指导等。
大部分地区的健康管理师考试采用机考形式，即《理论知识》和《操作技能》两门考试科目均为人机对话形式，考生需操作电脑作答。但因为当下健康管理师考试全都是由各个省市自主组织进行的，所以考试形式并不统一，具体情况考生还需咨询当地考试中心。
当前国家只开放了健康管理师三级的考试，健康管理师三级考试用书有两本，分别是《健康管理师基础知识》以及《健康管理师国家职业资格三级》，两本教材全都由人民卫生出版社出版。
根据有关记录，健康管理师考试的合格率在40%左右，一般来说自学的合格率低一些，参加机构培训的合格率会相对高一些。因为培训机构会根据学员的情况制定具体的学习计划，在备考健康管理师的过程中会为学员重点讲解考试的内容，帮助提高备考效率。
目前健康管理师已经取消全国统一考试，改成各个省自行组织考试，所以各个地方考试时间不一样。目前已经公布考试时间的地区有：重庆、四川、吉林、湖北、陕西、广西等地。考生如想了解所在地的健康管理师考试安排，可关注当地考试中心公告。