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目前国家仅仅开放了健康管理师三级的考试，健康管理师三级考试用书有两本，分别为《健康管理师基础知识》与《健康管理师国家职业资格三级》，两本教材全部由人民卫生出版社出版。
三级健康管理师考试一般在3月、9月、6月、12月举行。目前三级健康管理师已取消全国统考，交由各省市自行安排考试，因此各地考试时间不一致，
三级健康管理师考试内容分成理论知识与操作技能两科。理论基础知识考试主要考核从业人员从事本职业应掌握的基本要求与相关知识要求，考试内容涵盖临床医学、预防医学、流行病学以及营养与食品安全等相关知识。技能操作主要考核从业人员干本职业应具有的技能水平，包括健康监测、健康风险评估和分析、健康指导等。
目前三级健康管理师考试是由各个省市自己组织进行的，所以考试形式并不一样。大部分地区的三级健康管理师考试采取机考形式，即《理论知识》与《操作技能》两门科目都是人机对话形式，考生需操作电脑作答试题。