补充养老保险：实际发生12万元，扣除限额＝200×5%＝10（万元），可扣除10万元；

补充医疗保险：实际发生8万元，扣除限额＝200×5%＝10（万元），可扣除8万元；

职工福利费：实际发生35万元，扣除限额＝200×14%＝28（万元），可扣除28万元；

职工教育经费：软件企业支付给职工的培训费可以全额扣除，所以支付的4万元培训费可以全额扣除，实际发生4万元，扣除限额＝200×8%＝16（万元），可扣除4万元，共扣除4＋4＝8（万元）；

工会经费：实际发生3.5万元，扣除限额＝200×2%＝4（万元），可扣除3.5万元。

合理工资总额200万元可以据实扣除。

综上分析，可税前扣除的金额＝200＋10＋8＋28＋8＋3.5＝257.5（万元）