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引起胆道感染的原因很多，主要为各种因素造成的胆道梗阻、功能障碍、胆道寄生虫、其他病原微生物的感染、胆道损伤和血运障碍等。
(1)梗阻因素：胆石病和胆管狭窄是造成胆道梗阻引起胆道感染的重要原因。胆石病、胆管狭窄和胆道感染常同时并存，互为因果，互相影响。
(2)感染因素：包括寄生虫感染、细菌感染和病毒感染等。胆道蛔虫病较多见。正常情况下胆道内可能存在少量细菌而不发病，在胆道梗阻、胆汁淤积时细菌得以停留和繁殖并引起胆道感染。致病菌可经血行播散、经十二指肠乳头逆行感染或经淋巴系统进入胆道。其中逆行感染受到更多的重视。
(3)局部供血障碍：严重创伤、烧伤、大量失血、休克、心衰、贫血、动脉硬化和胆道内压力增高等可造成胆道血液灌注量不足。局部缺血、缺氧则使胆道对致病因素如化学性刺激、细菌感染等更为敏感，因而极易招致胆道感染，甚至出现胆管壁或胆囊的坏疽、穿孔。
(4)其他：胆道畸形、胆道创伤和胆道运动功能障碍也可致急性胆道感染。
总之，上述各种因素往往同时存在，互相影响而致胆道感染。
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