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(1)轮状病毒肠炎：秋、冬季常见，故又称秋季腹泻。多发生在6～24个月的婴儿，起病急，常伴发热和上呼吸道感染症状，病初即有呕吐。常先于腹泻;大便次数多、量多，水分多，黄色水样便或蛋花样便带少量黏液，无腥臭味，常并发脱水、酸中毒及电解质紊乱。大便镜检有少量白细胞。本病为自限性疾病，病程约3～8天，少数病程较长。
(2)产毒性细菌引起的肠炎：轻症仅大便次数稍增，性状轻微改变;重症腹泻频繁，量多，呈水样或蛋花样，混有黏液，伴呕吐，常发生脱水、电解质和酸碱平衡紊乱。镜检无白细胞，本病为自限性疾病。病程3～7天，亦可较长。
(3)侵袭性细菌引起的肠炎：常见的有侵袭性大肠杆菌、空肠弯曲菌、耶尔森菌、鼠伤寒杆菌等。起病急，腹泻频繁，大便呈黏冻状，带脓血。常伴恶心、呕吐、高热、腹痛和里急后重，可出现严重的中毒症状，如高热、意识改变甚至出现休克。大便镜检有大量白细胞和数量不等的红细胞，大便细菌培养可找到相应的致病菌。
(4)出血性大肠杆菌肠炎：大便次数增多，开始为黄色水样便，后转为血水便，有特殊臭味;大便镜检有大量红细胞，常无白细胞。临床常伴腹痛、个别病例可伴发溶血性尿毒综合征和血小板减少性紫癜。
(5)抗生素诱发的肠炎：长期应用广谱抗生素可使肠道菌群失调。
金黄色葡萄球菌肠炎的典型大便为暗绿色，量多带黏液，少数为血便。大便镜检有大量脓细胞和成簇的革兰阳性球菌。
真菌性肠炎多为白色念珠菌所致，大便次数增多，黄色稀便，泡沫较多，带黏液，有时可见豆腐渣样细块(菌落)。大便镜检有真菌孢子和菌丝。