【内容考查】本题考查医疗机构违反药品不良反应报告规定的法律责任及处罚标准。【选项分析】根据《药品管理法》第一百三十四条规定，医疗机构未按照规定报告疑似药品不良反应的，责令限期改正，给予警告；逾期不改正的，处五万元以上五十万元以下的罚款。选项A的罚款数额过低，不符合法律规定；选项C的罚款数额是针对药品上市许可持有人的处罚标准；选项D中的`停产停业整顿`措施是针对药品经营企业的处罚，不适用于医疗机构。因此正确答案是选项B。