【内容考查】本题考查柠檬酸循环中底物水平磷酸化反应的相关知识。【选项分析】A. 柠檬酸合酶：催化乙酰CoA与草酰乙酸缩合成柠檬酸，不涉及底物水平磷酸化。B. 异柠檬酸脱氢酶：催化异柠檬酸氧化脱羧为α-酮戊二酸，不涉及底物水平磷酸化。C. α-酮戊二酸脱氢酶复合体：催化α-酮戊二酸氧化脱羧生成琥珀酰CoA，不涉及底物水平磷酸化。D. 琥珀酰CoA合成酶：正确。这是柠檬酸循环中唯一的底物水平磷酸化反应，催化琥珀酰CoA转变为琥珀酸的过程中，生成GTP。E. 苹果酸脱氢酶：催化苹果酸脱氢生成草酰乙酸，不涉及底物水平磷酸化。根据教材原文，"柠檬酸循环中只有一个底物水平磷酸化反应生成高能磷酸键"，这个反应是由琥珀酰CoA合成酶催化的。因此，正确答案是D选项。