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军团菌肺炎症状无特异性：持续高热、头痛、腹泻、低钠血症、血清肌酶升高、对β～内酰胺类抗菌药物无效。当上述情况出现时，应考虑军团菌肺炎的可能。一旦培养出军团菌，在组织分泌物中检出其抗原或血清学阳性等均可确诊。因为不存在带菌状态，痰培养阳性即可确定诊断。中国于1992年拟定了军团菌肺炎的诊断试行标准：
1临床表现：发热、寒战、咳嗽、胸痛;
2胸部X线摄片：炎症阴影;
3呼吸道分泌物、痰、血、胸腔积液：培养基中有军团菌生长;
4呼吸道分泌物：直接免疫荧光检测阳性;
5血清学检测：前后两次抗体滴度4倍增长达1：128以上。
凡是有1、2，且有具有3、4、5中任何一项便可诊断为军团菌肺炎。
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