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常见的致病菌有脑膜炎双球菌、流感嗜血杆菌、大肠杆菌、肺炎双球菌、葡萄球菌等，其中脑膜炎双球菌、流感嗜血杆菌最为多见。新生儿及小于2个月的患儿以革兰氏阴性细菌为主，如大肠杆菌、副大肠杆菌等，阳性球菌可见金黄色葡萄球菌感染。2个月至儿童期时，以流感嗜血杆菌、脑膜炎双球菌和肺炎双球菌为主，12岁以上的患儿常见脑膜炎双球菌和肺炎双球菌感染。
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