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卵巢癌鉴别诊断在临床上主要是将卵巢癌与卵巢其它疾病相区分，以达到对症下药的目的。
1、盆腔子宫内膜异位症：此病所形成的粘连性卵巢包块及子宫直肠陷凹结节与卵巢癌的症状十分相似，但此病常为生育期年龄病人，有进行性痛经，随月经周期加重及不孕等特征进行鉴别。必要时行腹腔或剖腹探查确诊。
2、慢性尿潴留：多有排尿困难或尿频尿不尽等症状，包块在下腹正中的位置，边界不清楚导尿后包块很快消失，用B超很容易检查两者区别。
3、附件结核或腹膜结核：常有结核病史，其临床表现也不一样，附件结核有消瘦、低热、盗汗、面色潮红、月经后错稀发、闭经等症状。腹膜结核腹水时出现粘连性肿块，特点是位置高，B型超声、X线胃肠造影等可帮助确诊，利于鉴别。
4、盆腔炎性包块：炎症可形成实质性、不整齐的固定包块，或宫旁结缔组织炎呈炎性浸润达盆壁与卵巢癌症状相似。盆腔炎性包块病人往往有人工流产术、上环、取环、产后感染等病史。盆腔炎主要表现为发热，下腹痛，病程长等临床表现，双合诊检查触痛明显，应用抗炎治疗包块缩小。在必要时要进行包块细胞学检查。
5、肝硬化腹水：根据肝硬化症状的表现，肝功能检查结果，盆腔检查有无包块，腹水的性状等不难鉴别，必要时做B超、CT等辅助检查。
6、卵巢良性肿瘤：良性肿瘤病程相对来说比较长，肿块逐渐增大，常发生于单侧，活动度较好，质地软，表面平整光滑，包膜完整无缺损，这种肿瘤比较常见，病人一般状况较好。相反，卵巢癌恶性肿瘤病程短，肿块生长比较快，活动度差，质地坚硬，表面不光滑有裂痕，经三合诊检查，可触知肿瘤有乳头状结节，并常常伴有全身或下肢浮肿、恶病质、血性腹等表现。必要的情况下可作腹腔镜及剖腹探查，以进一步明确诊断。