实行窗口发药的配方方法有三种方式：
1.独立配方法：各发药窗口的调剂人员从收方到发药均由一人完成。优点是节省人力，责任清楚。但对调剂人员要求较高，易发生差错。本配方发药方法只适合小药房和急诊药房的调剂工作。
2.流水作业配方法：收方和发药由多个人协同完成，1人收方和审查处方，1～2人调配处方、取药，另设1人专门核对和发药。这种方法适用于大医院门诊调剂室以及候药患者比较多的情况。
3.结合法：独立配方与分工协作相结合的方法。每个窗口配备2名调剂人员，1人负责收方、审查处方和核对发药，另外1人负责配方。这种配方方法效率高，差错少，人员占用也少，符合调剂工作规范化的要求，普遍适用于各类医院门诊调剂室。