甲公司取得乙公司股权属于同一控制下的企业合并，合并方应当在合并日按照所取得的被合并方在最终控制方合并财务报表中的净资产账面价值的份额及购买日最终控制方收购被合并方时归属于最终控制方的商誉作为长期股权投资的初始投资成本，合并方以发行权益性证券为合并对价的，发行权益性证券时所发生的发行费用，应自所发行权益性证券的溢价发行收入中扣除,溢价收入不足冲减的，应依次冲减盈余公积和未分配利润。所以，甲公司长期股权投资初始投资成本=被合并方所有者权益在最终控制方合并财务报表中的账面价值×持股比例＋购买日最终控制方收购被合并方时归属于最终控制方的商誉=3000×80%+200 = 2600（万元)。