本题考查驰名商标的保护原则与保护程序。

驰名商标的保护采取被动保护，因此只有提出请求认定为驰名商标且证明符合驰名商标标准的，方可享受驰名商标的保护，故D正确。A错误之处在于，甲公司可以请求乙公司停止侵权，更换名称，但无权要求撤销商号登记；B错误之处在于，我国驰名商标采取被动保护，驰名商标并非荣誉称号，应经过相关部门认定才可享受驰名商标特殊保护；认定驰名商标可以是国家知识产权局，也可以是指定的人民法院，行政部门对“级为”商标进行过驰名商标，只是认定驰名商标的证据之一，并非必要条件，C错误。

故本题正确选项为D。