本题考查政府对工程建设市场监管的主要内容和手段。

包括：市场准入管理、工程项目审批管理、政府投资项目（公共工程）管理、企业资质和专业人员资格管理、以信用监管为基础强化事中事后监管和实行联合审图和联合验收。

其中市场准入管理——全面实施市场准入负面清单制度，普遍落实“非禁即入”。全面推行轻微违法行为依法免予处罚清单。故A选项正确；

工程项目采用审批管理，故B错误；制定施工图设计文件采用联合审查和联合竣工验收管理办法，C选项错误；企业资质管理属于市场监管的主要内容和手段中企业资质和专业人员资格管理内容，故D选项错误；故本题正确答案为A选项。