本题考查增值税的征收率。

销售已使用3年的机器设备，外购进项税额已经抵扣，按适用税率计算缴纳增值税。

摩托车于2012年12月购入，进项税额未抵扣，因此应按简易办法依3%征收率减按2%征收增值税。

销售给小规模纳税人的钢材应按销售货物13%税率征收增值税。

应纳增值税=5100÷（1+13%）×13%+14000÷（1+3%）×2%+35000÷（1+13%）×13%=4885.12（元）。

故此题正确答案为C。

【点拨】此题考查销售自己使用过的固定资产如何处理，但是有一定难度，涉及雷点比较多：

一、首先明确销售自己使用过的固定资产选择什么计税方法如何判断。

销售购进的货物选择什么计税方法主要是看购进时是否进行过抵扣，如果没有抵扣过，那么是简易计税，如果抵扣过，就是一般计税方法。一般情况下，在题目没有明确告知是否进行过抵扣的情形下，我们默认2009年以后购进的都进行过抵扣。

所以题中5100一般计税；14000简易计税。
二、一般纳税人销售货物给小规模纳税人，应该按照一般纳税人一般计税，税率是13%。