全国基础测绘规划由国务院测绘地理信息行政主管部门会同国务院其他有关部门、军队测绘主管部门负责组织编制，故A错误。

国务院测绘地理信息行政主管部门根据国民经济和社会发展年度计划编制要求和全国基础测绘中长期规划，组织编制并提出全国基础测绘年度计划建议，报国务院发展改革主管部门。题干说的是年度计划，规范原文说的是年度计划建议。故B错误。

各级人民政府的职责，将基础测绘纳入本级国民经济和社会发展规划及年度计划，所需经费列入本级财政预算。

《测绘法》规定，军事测绘部门负责管理军事部门的测绘工作，并按照国务院和中央军事委员会的规定的职责分工负责管理海洋基础测绘工作。故D错误。