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(1)对城市排水的影响
城市内的河道，为雨水的排泄通道，除低洼地区需用泵站排水外，其余能以重力流形式排放。实施防洪工程，阻挡外部洪水入侵城区，有利减轻城区排涝压力。
城市河道中为考虑景观所设置的堰坝(形成蓄水面防止枯水期河道干枯)，要求河道蓄水面高程低于两岸排水口高程，对坡降较陡的河道，可设若干个堰坝形成梯级蓄水面，以防止对城市排水的影响。
(2)对城市排污的影响
堤防工程在设计时就要考虑与城市排污相衔接，一般情况下，工程不改变其原有排污口的位置和高程，故正常情况下城市污水多能顺利出流，只是在洪水期，由于外江水位高于排污口高程，会对污水出流产生影响。由于城市规划都要建设污水处理厂，可将各排放口污水集中汇流到污水处理厂，处理后到下游排放，届时，城市污水的排放将不受影响。
城市河道堰坝建设形成一定水面，有利于环境的改善，但排污入堰坝上游，在枯水季节对河道景观、水质会产生不利影响。除了加强污染源治理外，要求排污口设置在城市河道的最后一级堰坝下游，以保证城区河道水面水质良好。
(3)对交通的影响
防洪工程建设过程中，由于施工期土石砂料的运输，汽车运输量在某一时段某一路段将急剧增加，如调度不当，将影响交通运输的畅通，使原本拥挤的城区交通压力更为加大。运输车辆如果超载或被覆不当，途中常常会撒落土、石、砂料，如不及时清除，将造成路面损坏，而且造成路面扬尘，遇雨造成水土流失。防洪工程建成后，由于路况的改善，有利于城区交通的发展。但堤防工程高出地面，对城区跨江道路的交通将产生不利影响，为此要求在堤防建设过程中尽量作好与沿江道路的衔接工作，避免不利影响。
消除上述影响的主要措施是：①加强城区交通运输的管理，及时疏导拥挤路段;②要求施工车辆在运输时加盖网罩，防止撒落土、石、砂料，并加强对司机及装卸工人的教育，做到清洁装卸，清洁运输;③道路采用立交，与堤防交叉的道路，采用填高过堤道路，调整相关道路的坡度，在堤与路间形成的三角地带需作绿化，改善城市景观;④在交通桥梁的施工过程中会有大量泥浆涌出，要求集中排放，统一处理，以免淤积河道，影响环境。
对城市规划和生态环境的影响
城市防洪工程属于城市总体规划的内容之一。由于防洪工程在规划、设计过程中反复与城建部门协调、商量，各项工程措施与城市总体规划相统一，故工程建设不会影响城市总体规划，相反，防洪工程兴建后，有利于城市总体规划的实现。
防洪工程建设过程中，防洪堤的填筑、料场的开挖，均破坏了局部植被，使生态环境遭受一些破坏。而防洪工程兴建后，由于防止了洪水对城区的冲刷，有利于城区的植被生长和小区环境绿化，而且施工结束后在堤线上种植一些常绿观赏植物，河道两岸绿化带的建设使城区绿地面积增加，有利生态环境的改善。绿化带的建设还可以净化空气，降低噪声，改善景观，从而优化城市的环境质量。
对风景文物的影响
历史造就了城市大量的历史文物和名胜古迹。在防洪工程建设过程中，本着“保护第一、合理开发、永续利用”原则，防洪堤线要远离上述区域，不破坏其景观。
防洪工程建成后，河道两岸的堤防将高出城区某些地面高程，对城区居民的视觉环境带来一定程度的不利影响，影响观瞻。要求堤防建设尽可能满足城市生态及景观要求，可通过堤防的美化、装饰等来最大限度减轻对视觉环境的不利影响。同时堤顶设有盆景，竖墙设有浮雕，展现城市的过去与未来，堤线上设置一些亭台、楼阁，供游人歇息了望，堤防背水坡种草皮花卉，每隔一段距离上、下游坡设过堤便道，把防洪堤建成沿江的滨江道路，使其成为城市内的主要景观，并成为滨水休闲游憩性道路，给市民提供一个休闲、观光的场所。
对人居环境的影响
环境的建设是人类社会可持续发展的重要方面。建设人居环境除了必要的生活设施外，还需要优美的环境，其中亲水性是尤为重要的。历史上，把城市建在湖边、河岸及海滨有其必然的道理。城市防洪堤建设，使城区与水之间形成一道屏障，限制了城市居民与水的接触，因此城市防洪工程设计中，除了与流域防洪工程统一协调(如城市上游建防洪水库、在城市防洪标准范围内使水库尽可能地多蓄水、减少下泄量，从而减少城市河道水位变幅、降低防洪堤高度)、城区河道做堰坝蓄水外，防洪堤本身应设置一些亲水步道、亲水台阶、亲水广场、亲水绿道等滨水建筑物，供游人欣赏水的景色，亲近水的芳泽，从而产生人景交融的滨水景观。
对人群健康的影响
在城市防洪工程建设过程中，由于施工人员集中，生活卫生条件简陋，易造成疾病流行，需采取预防措施。而且由于流动人员多，粪便和垃圾若不妥善处理，水源易遭污染。因此，在施工集中区，要加强卫生检疫工作，确保饮用水源水质，加强疫情报告、预防服药和预防接种工作，切实做到“三早”——早预防、早发现、早隔离治疗。对生活污水、粪便和垃圾，要求城市环卫系统及时处理和清运。
在城市防洪工程施工时，噪声影响较大，要求采用低噪声的施工设备，并严禁夜间施工。
施工弃渣对环境的影响
在城市防洪工程建设过程中，由于土石方的开挖将产生弃渣，若处理不当，极易引起水土流失。为此，要求工程弃渣尽量用作堤防填筑，不能用于堤防填筑的废渣，可就近用于城区(如开发区)低地填高，这样变废为宝，减少城市建设费用，又有利于城区水土保持。