考查农村集体经济审计的含义。

农村集体经济审计的对象具有特定性。农村集体经济审计监督的对象主要是农村集体经济组织及其所属单位。

审计主体具有独立性。农村集体经济审计机构和人员属于相对独立的第三方，不参与农村集体经济组织的生产经营活动。A选项错误。

农村集体经济审计的方法具有多样性。方法主要包括查账、核对、盘点、询证、抽查、详查、调查、评价等。B选项错误。

农村集体经济审计的实施主体具有特定性。农村集体经济审计的业务指导工作由县级以上人民政府农村经营管理部门负责，一般在县、乡（镇）两级农村经营管理部门设立农村集体经济审计机构具体开展审计业务。C选项错误。

故选项D正确。