【内容考查】本题考查信息系统项目竣工验收阶段的文档验收和移交工作。

【选项分析】A：不正确。根据教材，文档要按照保存期限做好分类，不满足短期保存期限要求的可不列入文档验收范围。B：正确。这符合教材中提到的"协助业主单位按照业主单位档案管理要求或国家、地方和行业颁布的文档管理要求进行竣工文档归档工作"。C：不正确。教材明确指出文档要按照保存期限做好分类，而不仅仅是按项目阶段。D：不正确。教材指出保密项目或有保密协议的项目，应依照保密条款的约定进行文档的移交工作。因此，正确答案是B。