【内容考查】本题考查安全应急响应事件损失的定义及主要考虑因素。【选项分析】A. 系统软硬件的更新成本：虽然可能是恢复系统的一部分，但不是损失评估的主要考虑因素。B. 恢复系统正常运行的代价：正确。根据定义，安全应急响应事件的损失主要考虑恢复系统正常运行和消除安全事件负面影响所需付出的代价。C. 安全事件发生的频率：这是风险评估的因素，而非损失评估的主要考虑因素。D. 系统管理人员的培训费用：虽可能是间接成本，但不是损失评估的主要考虑因素。因此，正确答案是B。