本题考查信息系统战略三角中业务战略、信息系统和组织机制之间的协同关系，以及信息系统规划的动态调整原则。
选项A不符合题意，题目明确提到技术部署成功。
选项B与题目描述的问题现象不匹配。
选项C正确，根据信息系统战略三角理论，成功的信息系统部署需要业务战略、信息系统和组织机制三者保持一致性和动态平衡，题目中出现的员工抵触和业务流程混乱正是因为在部署信息系统时没有同步进行组织机制调整和业务流程优化。
选项D不是根本原因，问题在于缺乏整体战略协调。