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健康管理师的两个科目分别是《理论知识》和《操作技能》。理论知识考试主要考查从业人员从事本职业应掌握的相关知识要求，考试内容包括临床医学、预防医学、流行病学及营养与食品安全等相关知识。技能考试主要考查从业人员从事本职业应具备的技能水平，考查考生的实际应用能力，包括健康监测、健康风险评估和分析、健康指导等方面。
2021年以前，健康管理师考试是全国统考，每年会有3-4次考试，考试时间大概集中在4月、7月和11月。但是从2021年开始，健康管理师考试经历改革，考试改为由各个地区各自安排进行，因此各地区的考试时间不一样，考生如想要了解具体情况还需咨询当地考试中心。
目前健康管理师考试由各地自行组织，因此考试题型也不一样，常见的考试题型有：单选题、判断题、多项选择题、综合分析题、简答题等。考生如果想具体了解所在地健康管理师考试的题型，还需关注当地考试中心通知。
目前健康管理师考试是通过各地区自行安排进行的，考试形式不统一。大多数考区考试方式是上机考试，考生需要操作电脑完成答题。不过具体考试形式还是以当地考试中心通知为准。
健康管理师考试各科目时长是2小时。健康管理师考试分为《理论知识》和《操作技能》两个场次，大部分地区均用人机对话的考试形式，每场考试时长均为2小时，总计4小时。