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健康管理师的两个考试科目分别是《理论知识》和《操作技能》。理论知识考试主要考察从业人员从事本职业应掌握的相关知识要求，考试内容包括了临床医学、预防医学、流行病学及营养与食品安全等相关内容。技能考试主要考察从业人员从事本职业应具有的技能水平，考察考生的实际应用能力，包括健康监测、健康风险评估和分析、健康指导等方面。
2021年以前，健康管理师考试是全国统考，每年会有3-4次考试，考试时间基本集中在4月、7月与11月。但是从2021年开始，健康管理师考试经历改革，考试变为由各地区单独安排进行，因此各地区的考试时间不一致，考生如想要了解具体情况还需询问当地考试中心。
健康管理师考试各科目时长是2小时。健康管理师考试包括《理论知识》和《操作技能》两个场次，大部分地区都用人机对话的形式，每场考试时长均为2小时，共计4小时。
健康管理师在各省份省会城市或者地级市参加考试，一些地方还没开放考点，多数省份以省会城市为主要考点，详细考试地点根据考生个人准考证为主。
健康管理师考试每个科目60分合格。健康管理师考试科目分为《理论知识》和《操作技能》两门，各科满分均为100分，通过标准为60分，两科必须一次通过才算成绩通过。