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健康管理师的两个科目分别是《理论知识》与《操作技能》。理论知识考试主要考察从业人员从事该职业应掌握的相关知识要求，考试内容涵盖了临床医学、预防医学、流行病学以及营养与食品安全等相关内容。技能考试主要考察从业人员从事该职业应具备的技能水平，考查考生的实际应用能力，包括健康监测、健康风险评估和分析、健康指导等方面。
2021年之前，健康管理师考试是全国统一考试，每年会有3-4次考试，考试时间大概集中在4月、7月与11月。但是从2021年开始，健康管理师考试经历改革，考试改为由各地区各自安排进行，因此各地区的考试时间不一样，考生如想了解具体情况还需询问当地考试中心。
健康管理师考试各科目时长均是2小时。健康管理师考试包括《理论知识》和《操作技能》两场，大多数地区均采取人机对话的考试形式，每场考试时长均是2小时，总计4小时。
健康管理师在各个省份省会城市或者地级市参加考试，一些地方尚未开放考点，多数省份以省会城市考点为主要，具体考试地点以考生自己准考证为主。
目前健康管理师考试是通过各地区自行安排进行的，考试形式不一致。大部分地区考试方式为上机考试，考生要操作电脑完成答题。不过具体考试形式还是以当地考试中心公告为准。