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健康管理师的两个科目分别为《理论知识》与《操作技能》。理论知识考试主要考察从业人员从事本职业应掌握的相关知识要求，考试内容包括临床医学、预防医学、流行病学以及营养与食品安全等相关内容。技能考试主要考察从业人员从事本职业应具有的技能水平，考察考生的实际应用能力，包括健康监测、健康风险评估和分析、健康指导等方面。
2021年以前，健康管理师考试是全国统一考试，每年会有3-4次考试，考试时间大概集中在4月、7月和11月。但是从2021年开始，健康管理师考试经历改革，考试改为由各个地区各自组织进行，因此各地区的考试时间不一致，考生如想要了解具体情况还需询问当地考试中心。
健康管理师考试各科目时长是2小时。健康管理师考试分为《理论知识》和《操作技能》两个场次，大多数地区均采取人机对话的考试形式，每场考试时长均为2小时，总计4小时。
健康管理师的考试考点通常均是在各省的省会城市，考生准考证上会有具体的考试地点安排。报名健康管理师考试的考生，可以根据自身需要选择就近考点，但是选择外地考点时需要确认该考区是否接受外地考生报名。
健康管理师考试每科目60分合格。健康管理师考试科目分为《理论知识》与《操作技能》两门，各科总分均是100分，合格标准是60分，两科目必须得一次考过才算成绩合格。