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获取健康管理师证书的用处是很大的。持有健康管理师证书可申请国家技能补贴，各地区的补贴标准不等；取得健康管理师证书以后可以申请个税抵扣；部分相关工作因为考取了健康管理师证书会有更大的可能升职加薪；部分地区还能凭借健康管理师证书申请落户积分的加分。
自2019年开始，个人所得税增加了附加扣除项。根据相关规定可知，纳税人接受技能人员职业资格继续教育、专业技术人员职业资格继续教育的支出，在获得相关证书的当年，按照3600元定额扣除。健康管理师证同样在个税抵扣政策的行列，因此考取健康管理师证书能选择“继续教育”进行申报抵扣个税。
健康管理师合格证书一般是在考试分数公布之后两到三个月开始相继发放，但是各个地区具体的证书发放时间不统一，考生还是要以所在地考试中心通知为准。
健康管理师考试合格之后便可获得健康管理师证书。该证书首先会由各省级职鉴中心统一打印并颁发给各个培训合作机构，然后培训机构会通知成绩合格的考生领取健康管理师证书，考生可以根据需要选择现场领取或者快递邮寄的方式。
少部分允许考生个人报考的地区，成绩合格者可持本人身份证原件去地区指定地点直接领取证书。
从2021年起，人社部与卫健委全都退出健康管理师的鉴定与发证，改由人社部门认可的第三方社会评价机构颁发健康管理师职业技能等级证书。这一证书是全国通用、终身有效的。