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健康管理师考试共设置两门科目，也就是《理论知识》与《操作技能》测试。这两科考试满分为100分，均达到60分为通过。两门科目必须要一次通过，单科目通过成绩不予保留。
健康管理师目前不再是全国统考，历经2021年改革后，健康管理师考试由各省份单独组织进行，因此考试时间也不一致，考生需要以本地考试中心通知为准。
健康管理师的两个考试科目分别为《理论知识》与《操作技能》。理论知识考试主要考查从业人员从事该职业应掌握的相关知识要求，考试内容涵盖了临床医学、预防医学、流行病学以及营养与食品安全等相关知识。技能考试主要考查从业人员从事该职业应具有的技能水平，考察考生的实际应用能力，包括健康监测、健康风险评估和分析、健康指导等方面。
目前健康管理师考试是由各地区自行安排进行的，考试形式不一致。大部分考区考试方式为上机考试，考生要操作电脑进行答题。不过具体考试形式还是以当地考试中心公告为准。