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复旦相对办学时间久，经验和师资以及口碑和大学之间的排名要稍好一点。交大相对综合性较强，偏理工科多一点，制造业或电子信息行业考生较多。
一、复旦大学MBA
复旦大学是我国最早设立工商管理教育体系的高校，1917年创设商科，1985年恢复组建管理学院。推行“走出去、引进来”的国际化战略，与20多个国家和地区的90多所著名高等院校和研究机构建立多种形式的交流、合作关系。
复旦大学是1991年国家教育部首批批准开设MBA项目的9所院校之一。“第一批”的含义就是说这个院校MBA获得了国家足够的资金和政策支持，所以其发展史较长、含金量高、支持资源充足。
二、上海交大MBA
现在意义上的交大安泰和复旦管院的渊源很深，21世纪初由复旦管院调任骨干领导帮助交大管院和原师生一起共同奋斗、打造全新的安泰管院。2006年安泰管院与交大经济学院合并，对外正式挂牌上海交通大学安泰经济与管理学院。
上海交大是1994年国家教育部第二批批准开设MBA项目的17所院校之一。
三、面试难度比较
1、复旦MBA
复旦MBA对于面试优秀名额没有名额限制，也就是只要你符合面试优秀的标准复旦即可给出在职班C线/国际版B线，复旦是上海唯一一所自主划线院校，她可以通过报考人数以及考试难度来划分分数线。
这里肯定很多同学会问：“如果复旦对于面试优秀没有名额限制，那今年招收600人，会不会全部甚至大于600人是面试优秀呢?”一般这种极端情况不会出现，如果出现上述情况的话，复旦会根据面试优秀同学的联考分数来进行划分分数线，所以考生不用担心说给出面试优秀人数大于招生人数的情况。
也就是说如果报考复旦的同学其实无论你参加哪一批次的预审面试都可以，因为每一批次的标准都是一样的，不存在哪一批次给出面试优秀名额多，哪一批次给出面试优秀名额少。
2、上海交大MBA
上海交大MBA对于面试优秀名额有着名额限制，一般情况下是不超过总体报考人数的30%，有同学肯定要问了，这是为什么呢?
交大面试优秀线即国家东部线，国家东部线是由国家教育部来划定的，而不是交大自己划的，主动权掌握在国家教育部手里的时候，交大只能通过控制面试优秀名额比例来确保招收人数，打个比方：如果交大给出的面试优秀名额比例较多，而国家教育部划分国家东部线的时候分数又比较低的时候，这样势必会超出他的招生名额。
所以交大采用的方针是：给出一分部的面试优秀名额，另外的同学通过笔试跟面试总分排名来录取。如果你是报考交大MBA项目的同学我们建议你还是早一点参加预审面试为好，因为越是往后面试优秀名额肯定会越少。
综上所述，参加复旦MBA提前预审面试比参加交大MBA提前预审面试拿到面试优秀的概率要大。
这两所院校的提前面试你都可以去参加一下，提前面试过了，初试分数线也会低很多，你到时也可以根据自己的提前面试情况来决定报考的学校。