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1.纸色谱(pc)：适用于分离各种天然黄酮类化合物及其苷类混合物。(环球网校医学考试网整理如何用色谱法鉴别黄酮类化合物?相关知识点)混合物的鉴定常采用双向色谱法。以黄酮苷类来说，一般第一向展开采用某种醇性溶剂，如正丁醇-醋酸-水(4：1：5，上层)等，主要是根据分配作用原理进行分离。第二向展开溶剂则用水或其他含水溶液，如2～6%醋酸等，主要是根据吸附作用原理进行分离。
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黄酮类化合物苷元中，平面性分子如黄酮、黄酮醇、查耳酮等，用含水溶剂如3%～5%hoac展开时，(环球网校医学考试网整理如何用色谱法鉴别黄酮类化合物?相关知识点)几乎停留在原点不动(rf<0.02);而非平面性分子如二氢黄酮、二氢黄酮醇、二氢查耳酮等，因亲水性较强，rf 值较大( 0.10～0.30)。黄酮类化合物分子中羟基苷化后，极性随之增大，在醇性展开剂中rf 值相应降低，同一类型苷元，rf值依次为：苷元>单糖苷>双糖苷。但在用水或2～8%醋酸、3%氯化钠水溶液或1%盐酸展开时，则苷元几乎停留在原点不动，rf 值大小顺序为：苷元<单糖苷<双糖苷。
2.硅胶薄层色谱：用于分离和鉴定弱极性黄酮类化合物。分离黄酮苷元常用的展开剂是甲苯-甲酸乙酯-甲酸(5：4：1)。
3.聚酰胺薄层色谱：特别适合于分离含游离酚羟基的黄酮及其苷类。展开剂中多含有醇、酸和水。
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