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当疑为呼吸道感染性疾病时，应让患者取晨痰送检。取痰前用清水反复漱口后用力自气管咳出第一口痰于灭菌容器内，立即送检。对于痰量少或无痰的患者可采用支气管镜或气管穿刺法取得。为了避免污染菌的干扰，最好连查3次。注意事项：
①采集标本以清晨为佳，为减少口腔正常菌群污染标本，采集前应充分漱口。
②取痰标本应是深部的痰液而不是唾液，否则会影响检查结果。
③作结核分枝杆菌检查，痰量要多或留取24小时痰液，婴儿肺结核要用胃管取痰。
④约有1/4～1/2肺部感染患者可能发生菌血症，应同时作血培养。
⑤ 对一些特殊患者可采用支气管镜采集法及气管穿刺法取痰。