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药物经皮肤和粘膜表面吸收，均要穿越细胞类脂膜疏水区域，具有相似的吸收机理，但皮肤有一层致密的角质层强疏水结构，对药物穿越造成更大的屏障。
药物穿透生物膜的被动扩散，与药物的脂溶性有密切关系，一般用油/水分配系数衡量药物的脂溶性，油/水分配系数大，则脂溶性大，有利于药物跨膜转运。药物的被动吸收速率与药物的扩散系数有关，分子量大的药物，其扩散阻力大，扩散速率慢。难以穿透皮肤、肺泡表面生物膜、鼻腔粘膜等，因此分子量不宜超过1000，否则可要考虑加入促透剂，或采用离子导入等方法来促进吸收。生物膜的生理状态，如部位、结构、健康状态等均对药物的吸收造成影响，破损的皮肤或去除角质层的皮肤，角质层较薄的部位，药物的穿透阻力较小，吸收较快。肺泡表面药物的吸收迅速，远远大于透皮吸收。