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腓总神经在大腿后侧下1/3处由坐骨神经分出，分出后即斜向外下方，居于股二头肌深面的内侧，到达奈窝部时，经过腓肠肌外侧头的浅面及股二头肌内侧。此后腓总神经向外下方斜行，分出腓肠神绎的吻合支，与胫神经分支的腓肠内侧皮神经形成腓肠神经，分布于小腿后侧。主干绕到腓骨小头的外侧，在腓骨长肌内，绕过腓骨头，并在此处分为腓浅神经和腓深神经。腓深神经在腓骨长肌和趾长伸肌的深面，沿骨间膜前方与腓动脉伴行向下，主干发出分支，供胫前肌、母长伸肌、趾长伸肌和第三腓骨肌。腓浅神经向下经腓骨长、短肌与趾长伸肌之间，支配此二肌。并分布于足外侧皮肤。
腓总神经损伤比胫神经损伤发生率高，其主要特点为垂足畸形，在临床上是周围神经修复后效果最差者。