A. 经省级卫生行政部门批准后方可运输：正确答案。对于具有高度传染性和可能引起严重公共卫生问题的病原体，如鼠疫菌株，其运输必须经过相关卫生行政部门的批准。B. 在疾病预防控制机构指导下由医疗机构送往上级实验室：错误选项。虽然疾病预防控制机构会参与指导，但是没有提及需要经过相关卫生行政部门的批准，因此这个选项是错误的。C. 由医疗机构和上级实验室共同委托第三方运输：错误选项。尽管第三方运输公司在某些情况下可以参与运输，但是这并不适用于高度传染性的病原体，因为这可能会增加病原体泄露的风险。D. 由医疗机构直接送往上级实验室：错误选项。直接运输没有提及需要经过相关卫生行政部门的批准，因此这个选项是错误的。E. 由上级实验室自行来采取：错误选项。虽然上级实验室有能力处理这种病原体，但是没有提及需要经过相关卫生行政部门的批准，因此这个选项是错误的。题目考察知识点分析：这道题主要考察了传染病病原体运输的规定和程序。题目考察知识点扩展：在实际工作中，对于具有高度传染性的病原体，其运输必须严格遵守相关规定，以防止病原体的泄露，造成更大的公共卫生问题。此外，所有参与病原体运输的人员都应该接受相应的培训，了解如何正确、安全地处理和运输这些病原体。