A. 孕激素长期刺激：孕激素主要在妊娠期间分泌，对于非孕期的女性，孕激素水平不会过高，因此不会导致子宫肌层痛。B. 子宫内膜功能层缺陷：这通常会引起月经不规则或闭经，而非痛经。C. 子宫内膜随经血逆流：这可能导致子宫内膜异位症，但病例中并未描述有相关症状或体征。D. 雌激素刺激：雌激素可以促进子宫内膜生长，但是并不直接导致痛经。E. 子宫内膜侵入肌层：这是子宫肌瘤的典型症状，与病例描述的症状一致。所以，正确答案是E。题目考察知识点分析：这道题主要考察了子宫肌瘤的诊断。子宫肌瘤是一种常见的妇科良性肿瘤，主要症状包括痛经、月经过多、盆腔痛等。体检可能发现子宫增大，质硬。题目考察知识点扩展：子宫肌瘤的诊断主要依靠妇科检查和影像学检查，如超声或MRI。治疗方式包括药物治疗、手术治疗等，具体方案需要根据患者的年龄、症状严重程度、肿瘤大小和位置等因素综合考虑。