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阿米巴病由溶组织内阿米巴感染所引起。没有任何临床表现而只在其粪便内查到包囊的感染者，称为带囊者。该原虫主要寄生于人体结肠，少数病例结肠壁中的阿米巴也可随血流运行或偶以直接侵袭方式，到达肝、肺、脑、皮肤、宫颈、阴道等处，引起相应部位阿米巴溃疡或阿米巴脓肿。因此阿米巴病是一种可累及许多脏器和组织的全身性疾病。
寄生于人体肠道内的阿米巴有4属7种之多，其中仅有溶组织内阿米巴能引起阿米巴病。本病呈全球性分布，以热带及亚热带地区流行最为严重。估计有患者4.8亿之多，每年死亡人数为4－11万。人群感染率与当地社会经济文化水平的高低、卫生条件的优劣及生活习惯的好坏密切相关，分为高、中、低度三种流行区。我国属于中度流行区，总体来说，南方多于北方，农村多于城市，男性多于女性，儿童多于成人。