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临床执业医师资格考试不需要每科都合格，只需要所有科目总分到达及格线即可。临床医师共考四门考试科目，并不需要每门考试科目都是合格的，只要四门科目的总分达到了及格线，即可申请执业医师证书。
全国临床执业医师考试的合格分数线在国家医学考试网或各地卫生健康委员会官网公布，望考生注意查看相关信息。
临床执业医师考试通过之后，不用等到证书下来，即可凭考试通过的通知单在网上实行电子化注册，年限是从注册成功的那天开始算起的。临床执业医师证书注册程序如下：
拟在医疗、保健机构中执业的人员，要向批准该机构执业的卫生计生行政部门申请注册；拟在预防机构中执业的考生，要向该机构的同级卫生计生行政部门申请注册。
在同一个执业地点多个机构执业的医师，要确定一个机构作为其主要执业机构，并向批准该机构执业的卫生计生行政部门申请注册；医师有且只有一个执业机构的，视为其主要执业机构。医师跨执业地点增加执业机构，应当向批准该机构执业的卫生计生行政部门申请增加注册。执业助理医师只可以注册一个执业地点。
取得证书之后，最晚是要在两年内完成注册的。一般来说，各地的卫生局每年会有一个统一注册的时间段，这个时间都是由当地卫生局决定的。
国家从2016年起电子注册目前全国多数地区开始电子注册了，一般结果公布之后就开始了，每个地区注册时间都不一样，根据各地安排去注册，国家一般要求在12月31日前注册完毕。