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儿童龋齿的原因主要包括细菌、口腔环境、宿主和时间：
1.细菌
是龋病发生的必要条件，一般认为致龋菌有两种类型，一种是产酸菌属，其中主要为变形链球菌、放线菌属和乳杆菌，可使碳水化合物分解产酸，导致牙齿无机质脱矿；另一种是革兰氏阳性球菌，可破坏有机质，经过长期作用可使牙齿形成龋洞。
2.口腔环境
口腔是牙齿的外环境，与儿童龋齿的原因密切相关，其中起主导作用的主要是食物和涎液。
（1）食物：主要是碳水化合物，既与菌斑基质的形成有关，也是菌斑中细菌的主要能源，细菌能利用碳水化合物代谢产生酸，并合成细胞外多糖和细胞内多糖，所产的有机酸有利于产酸和耐酸菌的生长，也有利于牙体硬组织的脱矿。
（2）涎液：涎液的量和质发生变化时，均可影响龋患率，在正常情况下，涎液有以下几种作用：机械清洗作用减少细菌的积聚；抑菌作用直接抑菌或抑制菌斑在牙面的附着；抗酸作用由所含重碳酸盐类等物质起中和作用；抗溶作用通过所含钙、磷、氟等增强牙齿抗酸能力，减少溶解度。
3.宿主
牙齿是儿童龋齿过程中的靶器官，牙齿的形态、矿化程度和组织结构与龋病发生有直接关系，如牙齿的窝沟处和矿化不良的牙较易患龋，而矿化程度较好、组织内含氟量适当的牙抗龋力较强；另方面，牙齿的结构与机体有密切关系，尤其是在发育中，不仅影响到牙齿的发育和结构，而且对涎液的流量、流速及其组成也有很大影响。
4.时间
儿童龋齿的发生有一个较长的过程，从初期龋到临床形成龋洞一般需1.5~2年，因此即使致龋细菌、适宜的环境和易感宿主同时存在，龋病也不会立即发生，只有上述三个因素同时存在相当长的时间，才可能产生龋坏，所以时间因素在儿童龋齿的原因中具有重要意义。
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