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腺周口疮的发病原因同复发性阿弗他溃疡，目前病因及致病机制仍不明，存在明显的个体差异，目前趋向于认为该病是多种因素综合作用的结果。
1.免疫因素：免疫功能失调被认为是该病的重要因素。
①细胞免疫异常;
②体液免疫异常和自身免疫失调;
③免疫功能低下和免疫缺陷。
2.遗传因素：对复发性阿弗他溃疡的单基因遗传、多基因遗传、遗传标记物和遗传物质的研究表明，复发性阿弗他溃疡的发病有遗传倾向。
3.系统性疾病因素：复发性阿弗他溃疡与胃溃疡、十二指肠溃疡、溃疡性结肠炎、局限性肠炎、肝炎、肝硬化、胆道疾病有密切关系。内分泌系统的疾病如糖尿病、甲状腺疾病、月经紊乱等也与复发性阿弗他溃疡有一定关系。
4.环境因素：心理环境、生活工作环境、社会环境等均与复发性阿弗他溃疡有很大关系。精神紧张、营养失衡、微循环障碍、生活节奏过快和不良生活习惯等因素都会诱发复发性阿弗他溃疡。吸烟者复发性阿弗他溃疡发病率较不吸烟者低。
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