甲公司对乙公司长期股权投资的初始投资或本为3 500万元，选项A错误；甲公司实际支付的款项3 500万元小于享有被投资方可辨认净资产的公允价值份额3 600万元（9 000×40％），差额计入当期损益（营业外收入），选项B正确；2×20年度甲公司对乙公司长期股权投资应确认的投资收益＝800×40％＝320（万元），甲、乙公司之间借款形成的利息费用不属于未实现内部交易损益，无须对投资收益进行调整，选项C正确；投资后因乙公司其他综合收益变动调整对乙公司长期股权投资账面价值＝100×40％＝40（万元），选项D正确。