本题考查的是生产过程危险和有害因素分类中的管理因素。
A选项“未制定特种设备安全操作规程”属于管理因素中的“职业安全卫生管理制度不完善或未落实”。
B选项“企业专职安全生产管理人员数量少于法定要求”明确属于管理因素中的“职业安全卫生管理机构设置和人员配备不健全”，符合题意。
C选项“冲压车间噪声过大”属于物的因素中的“物理性危险和有害因素”。
D选项“新入职员工未经过三级安全教育培训即上岗”通常归类为管理因素中的“职业安全卫生管理制度不完善或未落实”（培训制度落实不到位）或“其他管理因素缺陷”，不属于机构设置和人员配备问题。