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目前通用的分类方法将干扰素分为三型：
Ⅰ型：有IFN-α和IFN-β，其中IFN-α有二十余个亚型，IFN-β仅有一个亚型。Ⅰ型干扰素具有抑制病毒复制、抗寄生虫、抑制多种细胞增殖、刺激免疫细胞的杀伤活性、参与免疫调节、抗肿瘤等作用。
Ⅱ型：只有IFN-γ，且只有一种亚型，除具有抗病毒、抗增殖活性外，其主要生物学活性为免疫调节作用。
Ⅲ型：即IFN-λ1(IL-29)、IFN-λ2(IL-28a)和IFN-λ(IL-28b)。
IFN-ω属于IFN-α家族，其结构和大小与其它IFN-α稍有差异，但抗原性有较大的不同。
自80年代以来，许多研究显示，干扰素(尤其是α-干扰素及γ-干扰素)除具有抗病毒、免疫调节的作用外，还具有明显的抗细胞增殖作用。因此，目前干扰素已被用于治疗多种白血病。
1. 天然IFN
根据国际干扰素命名委员会的建议，天然IFN一般首先按动物来源分类，例如人干扰素(HuIFN)，牛干扰素(BovIFN)等，然后再按IFN的抗原特异性和分子结构分成不同的型别，加以命名。
天然干扰素种类繁多，分子量也不同，亦有不同的抗原性。目前了解由人的不同细胞产生的干扰素至少有三种不同的抗原成分：白细胞干扰素抗原(Le)，人成纤维细胞干扰素抗原(F)和T淋巴细胞干扰素抗原(T)。事实上，人白细胞产生的干扰素有99% 为Le，1%为F，人成纤维细胞产生的干扰素占80-99.9%;而由Namalva细胞系(为一种由Burkitt淋巴瘤患者所得的类淋巴细胞系)产生的干扰素中有85%为Le,15%为F. 唯有T淋巴细胞产生的干扰素则因应用不同诱生剂而不同，如以短小棒状杆菌诱导，主要为Le(>95%); 如果用PHA或诱导，则主要产生T(>80%). 根据世界卫生组织规定，统一个名，将人细胞所产生的几种干扰素，按其抗原性不同分为α、β和γ三类，Le干扰素即为α-干扰素(IFN-α)，F干扰素为 β干扰素(IFN-β)。T-干扰素即γ干扰素(IFN-γ)。
通过核酸内切酶切割分析，从而搞清了其全部核苷酸的顺序，由此又推导出全部核苷酸顺序，在α、 β与γ三型干扰素中又因各型中又有氨基酸的顺序不同，又可分为若干亚型，α-干扰素至少有20个以上的亚型。而β-干扰素则有4个亚型，至于γ-干扰素只有一个亚型。α一干扰素的亚型为IFN-αl，IFN-α2，IFN-α3等或IFN-αA，IFN-αB，IFN-αC等。
2. 非天然 IFN
主要指基因工程IFN，即以DNA重组技术生产的IFN。基因工程IFN具有与天然IFN完全相同的生物学活性。
从cDNA途径建立IFN-2α无性繁殖系的基本步骤包括，人 IFN-αmRNA的诱生，mRNA的提取与纯化、基因克隆与重组、转化大肠杆菌和基因表达。
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