本题考查工程项目管理基本的组织结构形式。

直线职能式组织有两套系统：一是按命令统一原则设置的指挥系统；二是按专业化原则设置的管理职能系统。直线部门和人员在自己的职责范围内有决定权，对其所属下级的工作进行指挥和命令，并负全部责任。而职能部门和人员仅是直线主管的参谋，只能对下级机构提供建议和业务指导，没有指挥和命令的权力。

1.特点：既保持了直线式统一指挥的特点，又满足了职能式对管理工作专业化分工的要求。

2.优点：集中领导、职责清楚，工作效率高。B选项错误

3.缺点：下级部门的主动性和积极性发挥受到限制；部门间横向联系差，信息传递路线长。AC选项正确

当职能部门与指挥部门之间目标不一致时，容易产生矛盾，致使上层主管的协调工作量增大；

难以从组织内部培养熟悉全面工作的管理人才；整个组织系统的适应性较差，对新情况不能及时作出反应。DE选项正确。

故本题选ACDE。